Ang Wachowskis, direktor ng sikat na Matrix movie, ay personal na lumapit kay Hideo Kojima noong late 1990s para gumawa ng Matrix video game. Ayon sa dating Konami executive na si Christopher Bergstresser, pumunta mismo ang Wachowskis sa Konami HQ para makipagkita kay Kojima.
Sa meeting, sinabi umano ng Wachowskis, “Gusto naming ikaw ang gumawa ng Matrix game.” Ngunit matapos isalin ito sa Japanese, diretsahang tumanggi si Kazumi Kitaue, executive ng Konami. Ayon sa ulat, malungkot at nadismaya si Kojima at ang kanyang team dahil gusto talaga nilang ituloy ang proyekto.
Noong Agosto 25, 1999, nakumpirma rin sa diary ni Kojima na nagkita sila ng Wachowskis at ng concept artist na si Geoff Darrow sa Japan, sa araw mismo ng premiere ng Matrix. Dito rin nagsimula ang mga usapan na baka Metal Gear Solid team ni Kojima ang gagawa ng laro.
Ngunit dahil sa desisyon ng Konami, hindi natuloy ang proyekto. Sa halip, ibang kumpanya ang nag-develop ng mga Matrix games na lumabas makalipas ang ilang taon. Kung natuloy ito, maaaring nagkaroon ng Matrix game na gawa ni Kojima—isang ideyang ikinalungkot ng maraming fans hanggang ngayon.
(Note: Ang orihinal na presyo ng mga laro noon ay nasa humigit-kumulang ₱3,000–₱4,000 kada kopya.)
